Cuando los ángeles atacan, NERV y sus pilotos de las unidades Evangelion deberán batallar para salvaguardar la ultima esperanza del hombre. Pero ¿Realmente NERV lucha para evitar la aniquilación a manos de los enviados divinos? ¿O acaso la esperanza en el porvenir de la humanidad ha quedado confiada en las manos de sus enemigos?