En un mundo únicamente poblado por Pokémon y sin ningún entrenador, como en los videojuegos de Pokémon Mundo Misterioso, aparece nuestro protagonista, un Porygon, el cual anda perdido por el bosque y sin recuerdos. Afortunadamente, un pequeño y adorable Oshawott aparece justo a tiempo. Es entonces cuando se forja una leal y noble amistad. ¿Que aventuras les deparará el futuro?
Es una noche oscura y lluviosa, y calado de frío levito por el bosque. No se oye ni un alma, cuando de pronto, un enorme Pokémon con un solo ojo se me acerca lentamente.